RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OTULINQ96BN8 352 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CPNE1Q99829 537 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AHSA2Q719I0 299 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLAAQ9Y263 795 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.61□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC72A6NJI9 287 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRLP01236 227 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GLULP15104 373 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCF3P15923 654 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MARK3P27448 753 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GALNT3Q14435 633 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MELKQ14680 651 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.673e-9■□□□□ 10.7
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCP11X2Q5H9J9 407 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RGSL1A5PLK6 1076 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MFN2O95140 757 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MANEALQ5VSG8 457 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCUBE2Q9NQ36 999 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRABP2P29373 138 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGEA8P43361 318 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MPPE1Q53F39 396 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDC73Q6P1J9 531 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRPV3Q8NET8 790 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 S100A13Q99584 98 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C3orf18Q9UK00 162 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FPGTO14772 594 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP4F2P78329 520 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP4F3Q08477 520 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABCB6Q9NP58 842 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PMM2O15305 246 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHRNB4P30926 498 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTHFRP42898 656 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITKQ08881 620 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF527Q8NB42 609 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLCG1P19174 1290 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HPCAL1P37235 193 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNTA1Q13424 505 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GALNT12Q8IXK2 581 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 METTL6Q8TCB7 284 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF558Q96NG5 402 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COG4Q9H9E3 785 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHMP2AO43633 222 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNAP25P60880 206 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NCOA4Q13772 614 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NAA35Q5VZE5 725 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM74Q96NL1 305 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF670Q9BS34 389 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EXO5Q9H790 373 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SUGCTQ9HAC7 445 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms