RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 LRRTM3Q86VH5 581 aa17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ZNF354CQ86Y25 554 aa17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SPATA13Q96N96 652 aa17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 VCX3BQ9H321 246 aa17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 JCHAINP01591 159 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ADRA1BP35368 520 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 DAOAP59103 153 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 FKBP1BP68106 108 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ARHGAP24Q8N264 748 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 NPY6RQ99463 290 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 WDCPQ9H6R7 721 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CAB39LQ9H9S4 337 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 DNAJC6O75061 913 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CIB2O75838 187 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 WARSP23381 471 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 PBX3P40426 434 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CDK7P50613 346 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CERCAMQ5T4B2 595 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ULK2Q8IYT8 1036 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 TOP6BLQ8N6T0 577 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CENPKQ9BS16 269 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 TMEM165Q9HC07 324 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SLC7A8Q9UHI5 535 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 DAB1O75553 588 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 KRT72Q14CN4 511 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 OTOP3Q7RTS5 596 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 RSPH3Q86UC2 560 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 OR10T2Q8NGX3 314 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SPC25Q9HBM1 224 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 TXNDC16Q9P2K2 825 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 OR12D3Q9UGF7 316 aa17.03■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SCN4AP35499 1836 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 TM9SF1O15321 606 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 STK10O94804 968 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 OR6B1O95007 311 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 GPR15P49685 360 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 DLG2Q15700 870 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 CES4AQ5XG92 561 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 TAF2Q6P1X5 1199 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 STRADAQ7RTN6 431 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 TAC4Q86UU9 113 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 RASSF3Q86WH2 238 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 SPATA22Q8NHS9 363 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 PYDC1Q8WXC3 89 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 AGAP2Q99490 1192 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 DHRS4Q9BTZ2 278 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 PREBQ9HCU5 417 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 USP3Q9Y6I4 520 aa17.02■□□□□ 0.32
PFKL-211ENST00000498841 B4GALT3O60512 393 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 HMBSP08397 361 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 GRIK1P39086 918 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 AP2B1P63010 937 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 WASHC5Q12768 1159 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 MFSD3Q96ES6 412 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 HCSTQ9UBK5 93 aa17.02■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 HMX2A2RU54 273 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 TPP1O14773 563 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 BST1Q10588 318 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 ZBTB17Q13105 803 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 C6orf163Q5TEZ5 329 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 LPCAT4Q643R3 524 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 TMPRSS6Q8IU80 811 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 MTBPQ96DY7 904 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 MPP6Q9NZW5 540 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 NDC80O14777 642 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 GCATO75600 419 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 RFPL1O75677 317 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 LRIG2O94898 1065 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 NFKB1P19838 968 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 GRIA2P42262 883 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 RAP1GDS1P52306 607 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 TNS4Q8IZW8 715 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 HIPK4Q8NE63 616 aa17.01■□□□□ 0.31
PFKL-211ENST00000498841 ZNF778Q96MU6 729 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms