RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ISCUQ9H1K1 167 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ARL15Q9NXU5 204 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PLK2Q9NYY3 685 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 WWOXQ9NZC7 414 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 LRP12Q9Y561 859 aa3.52□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ACKR2O00590 384 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 NGFRP08138 427 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 MLH1P40692 756 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PNLIPRP1P54315 467 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ZXDBP98169 803 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ZBTB16Q05516 673 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 RPS6KA2Q15349 733 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PLK5Q496M5 336 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 GALNTL6Q49A17 601 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 LIN54Q6MZP7 749 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 POF1BQ8WVV4 589 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 MIB2Q96AX9 1013 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PIGSQ96S52 555 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 RMDN3Q96TC7 470 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 MAGEH1Q9H213 219 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 BAG5Q9UL15 447 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.51□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TMEM247A6NEH6 219 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 GRM8O00222 908 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 HLA-DQA2P01906 255 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CYP1A2P05177 515 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CPA1P15085 419 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ARSBP15848 533 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 KLRC2P26717 231 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SERPINA4P29622 427 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CYP2J2P51589 502 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 EGR4Q05215 589 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CDK18Q07002 472 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 DCTN1Q14203 1278 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 BRD3Q15059 726 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 KDM1BQ8NB78 822 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 C3orf49Q96BT1 292 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 Q9N2J8 555 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 DACT1Q9NYF0 836 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SELENONQ9NZV5 590 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 LRFN1Q9P244 771 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.5□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 C4orf47A7E2U8 309 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 F5H423 210 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SLC28A2O43868 658 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 HOXC6P09630 235 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 TNFSF8P32971 234 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 ENTPD1P49961 510 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 SELENOVP59797 346 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 FOXO1Q12778 655 aa3.49□□□□□ -1.85
CMC1-211ENST00000495428 MORC3Q14149 939 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms