RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF284Q2VY69 593 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPTQ96BT3 561 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDNQ99608 321 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO9BQ13459 2157 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM1AO60341 852 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIL2Q13356 520 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6AP2O75787 350 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGFRP00533 1210 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ME2P23368 584 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMP13P45452 471 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSSP48637 474 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNG1P51959 295 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STARD3Q14849 445 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAP1GAP2Q684P5 730 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC2Q96KP1 924 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.87■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAB1O75553 588 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA13P48723 471 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAP1GDS1P52306 607 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTBP1Q13363 440 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PFKFB4Q16877 469 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGAT4DA6NG13 374 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC166P0CW27 439 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRABP2P29373 138 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 S100A5P33763 92 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPC1P35052 558 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHB3P54753 998 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD86P42081 329 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VAC14Q08AM6 782 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC27Q6P3X3 843 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRABD2AQ86V40 505 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FIG4Q92562 907 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VAT1Q99536 393 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB27AP51159 221 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTP1P59025 263 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL22Q9GZX6 179 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.86■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA2O43364 376 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX1O43933 1283 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERBB2P04626 1255 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAR1AQ9NR31 198 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2CD2Q9Y426 696 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALOX15BO15296 676 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR47O94967 919 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR141Q7Z602 305 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR6Y1Q8NGX8 325 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPOCK2Q92563 424 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KPNA6O60684 536 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNB1P14635 433 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP4AP20648 1035 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GBE1Q04446 702 aa16.85■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms