RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	TSPAN3	O60637	253 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PRAMEF11	O60813	436 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TJP3	O95049	919 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	GOT1	P17174	413 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TGM2	P21980	687 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	NTSR1	P30989	418 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	NNMT	P40261	264 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CSNK1D	P48730	415 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	DGKE	P52429	567 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	GALNT2	Q10471	571 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	LMAN2	Q12907	356 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	XRCC4	Q13426	336 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PON2	Q15165	354 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PTPRN	Q16849	979 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	GEN1	Q17RS7	908 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MBLAC2	Q68D91	279 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	BBS12	Q6ZW61	710 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PQLC3	Q8N755	202 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PLD5	Q8N7P1	536 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TTC13	Q8NBP0	860 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	FRS2	Q8WU20	508 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	ALG3	Q92685	438 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MYO19	Q96H55	970 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PSMB7	Q99436	277 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TLR10	Q9BXR5	811 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PLK2	Q9NYY3	685 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MPP6	Q9NZW5	540 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	SUN2	Q9UH99	717 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	SCML1	Q9UN30	329 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TFR2	Q9UP52	801 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	TECTA	O75443	2155 aa		6.06	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0D9SEW6	157 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	LRRD1	A4D1F6	860 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	HACD1	B0YJ81	288 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	WASH3P	C4AMC7	463 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	RASA4B	C9J798	803 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MCF2L	O15068	1137 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	DAPK3	O43293	454 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	RASA4	O43374	803 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	BUB1	O43683	1085 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CD160	O95971	181 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PEX11B	O96011	259 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	EGF	P01133	1207 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	IGLV3-19	P01714	112 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	APOC2	P02655	101 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	RHOC	P08134	193 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	PYGM	P11217	842 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CCNC	P24863	283 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	AVPR2	P30518	371 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CD70	P32970	193 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CSK	P41240	450 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MAPK8	P45983	427 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	SOX9	P48436	509 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	IRAK1	P51617	712 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CCR3	P51677	355 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	NRL	P54845	237 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	IL10RB	Q08334	325 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	MESP2	Q0VG99	397 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	KRT81	Q14533	505 aa		6.05	□□□□□ -1.44
NFX1-205	ENST00000466359	GRM3	Q14832	879 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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