RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM122A	Q96E09	287 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PEBP4	Q96S96	227 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZWILCH	Q9H900	591 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		15.01	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	WASH3P	C4AMC7	463 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ATP9B	O43861	1147 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA10	O95299	355 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	EPHX1	P07099	455 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	GABRG2	P18507	467 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEA1	P43355	309 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TPI1	P60174	286 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	GNA12	Q03113	381 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB16	Q05516	673 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	DMWD	Q09019	674 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T3	Q8NH03	318 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HMGB4	Q8WW32	186 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SPACA7	Q96KW9	195 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241		R4GN57	208 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM186A	A6NE01	2351 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	CREB3	O43889	395 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RAMP2	O60895	175 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	KRT7	P08729	469 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFV2	P19404	249 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ARL4A	P40617	200 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	WAS	P42768	502 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SLC1A1	P43005	524 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PARP15	Q460N3	678 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PSMB7	Q99436	277 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	VPS51	Q9UID3	782 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RAB23	Q9ULC3	237 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SCML1	Q9UN30	329 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RAD54B	Q9Y620	910 aa		14.99	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241		H3BRJ5	948 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ALOX15B	O15296	676 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	HR	O43593	1189 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV3-19	P01714	112 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	IL1R2	P27930	398 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	P2RY2	P41231	377 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	NDST2	P52849	883 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	COPA	P53621	1224 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	RFX8	Q6ZV50	586 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	VSIG1	Q86XK7	387 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM139	Q8IV31	216 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	LZTR1	Q8N653	840 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	FAM71B	Q8TC56	605 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	LOXL4	Q96JB6	756 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	BTBD6	Q96KE9	485 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	CEP44	Q9C0F1	390 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		14.98	□□□□□ -0.01
PTPA-222	ENST00000445241	THADA	Q6YHU6	1953 aa		14.98	□□□□□ -0.01

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