RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 GOLGA8SH3BPF8 625 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 I6L893 689 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 IGHV4-34P06331 123 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 GOT1P17174 413 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 RDXP35241 583 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 PSMD8P48556 350 aa28.53■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 C2CD6Q53TS8 623 aa28.53■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 NAXDQ8IW45 347 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC20A1Q8WUM9 679 aa28.53■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 LGALS16A8MUM7 142 aa28.52■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 SH3BP5O60239 455 aa28.52■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM16O95361 564 aa28.52■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 MMP8P22894 467 aa28.52■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 KRT83P78385 493 aa28.52■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 NCEH1Q6PIU2 408 aa28.52■■■□□ 2.16
ANKRD54-203ENST00000407117 HAPLN3Q96S86 360 aa28.52■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa28.52■■■□□ 2.16
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ANKRD54-203ENST00000407117 AADATQ8N5Z0 425 aa28.51■■■□□ 2.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 ENDOD1O94919 500 aa28.5■■■□□ 2.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 C6orf118Q5T5N4 469 aa28.49■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM131CQ96AQ9 280 aa28.49■■■□□ 2.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 UBXN1Q04323 297 aa28.48■■■□□ 2.15
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ANKRD54-203ENST00000407117 KDM4CQ9H3R0 1056 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 SNX11Q9Y5W9 270 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 SNX10Q9Y5X0 201 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 CACNA1BQ00975 2339 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 DRD3P35462 400 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF783Q6ZMS7 281 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-203ENST00000407117 Q6ZVU0 165 aa28.47■■■□□ 2.15
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