RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CA3P07451 260 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CCNB1P14635 433 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NFKB1P19838 968 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PPP3CCP48454 512 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CLCN4P51793 760 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TMC8Q8IU68 726 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CYP4X1Q8N118 509 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MCUQ8NE86 351 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TTC16Q8NEE8 873 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TEKT5Q96M29 485 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CERS4Q9HA82 394 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 UBP1Q9NZI7 540 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RASA4BC9J798 803 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MATN3O15232 486 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RASA4O43374 803 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GLUD1P00367 558 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HDCP19113 662 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GCAP28676 217 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ATP1A2P50993 1020 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TTC25Q96NG3 672 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CORO1BQ9BR76 489 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PRU2 124 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 F5H5T6 163 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PER2O15055 1255 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 USP12O75317 370 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD2P08910 425 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 MYL4P12829 197 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 OR1E1P30953 314 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ACVRL1P37023 503 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 CRADDP78560 199 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC38Q502W7 563 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC149Q6ZUS6 474 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 OR52K2Q8NGK3 314 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PLD4Q96BZ4 506 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 TLCD1Q96CP7 247 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 TBK1Q9UHD2 729 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ASB3Q9Y575 518 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 NOTCH4Q99466 2003 aa15.7■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 EPCAMP16422 314 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PBX2P40425 430 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 CCR2P41597 374 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEA3P43357 314 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 SLC11A2P49281 568 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 NDST2P52849 883 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf22Q49AR2 442 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 FBF1Q8TES7 1133 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 CFAP36Q96G28 342 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 IL12RB2Q99665 862 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0D9SEW6 157 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 MTSS1O43312 755 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PEX11BO96011 259 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF33AQ06730 810 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 STAT4Q14765 748 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PPM1LQ5SGD2 360 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 PGM2Q96G03 612 aa15.69■□□□□ 0.1
CASQ1-201ENST00000368078 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms