RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GHITMQ9H3K2 345 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.41□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 A0A1W2PQJ5 194 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 LRRC53A6NM62 1247 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 H3BSA7 217 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PJA2O43164 708 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 CCDC22O60826 627 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SLITRK3O94933 977 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 C1RP00736 705 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ANPEPP15144 967 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PON1P27169 355 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MTHFRP42898 656 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 TBX4P57082 545 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PTGDRQ13258 359 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 KRT81Q14533 505 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 AAGABQ6PD74 315 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 LRRC15Q8TF66 581 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 RIT2Q99578 217 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MIPEPQ99797 713 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 HPS4Q9NQG7 708 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.4□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 F8W810 466 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 HBP1O60381 514 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GAS8O95995 478 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ITGB3P05106 788 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FAM228BP0C875 321 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FGFR1P11362 822 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FOSL2P15408 326 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NR4A1P22736 598 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 JAK1P23458 1154 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 BMPR1AP36894 532 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ETV1P50549 477 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CASP5P51878 434 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PTPN5P54829 565 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MYL6P60660 151 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 IKBKEQ14164 716 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CGB2Q6NT52 195 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 TTI2Q6NXR4 508 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RASSF3Q86WH2 238 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ZNF677Q86XU0 584 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FBXL6Q8N531 539 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 HSPH1Q92598 858 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 BTBD2Q9BX70 525 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NDE1Q9NXR1 346 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 AMACRQ9UHK6 382 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 CHKBQ9Y259 395 aa7.4□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 LINC01553A4QN01 128 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 OR5K3A6NET4 321 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 LACTBL1A8MY62 500 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 GJB5O95377 273 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 AGTP01019 485 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 ITGAXP20702 1163 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 NR1H2P55055 460 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 PHC1P78364 1004 aa7.39□□□□□ -1.23
CCR6-202ENST00000349984 XIAPP98170 497 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms