RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF394Q53GI3 561 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SV2AQ7L0J3 742 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EXD3Q8N9H8 876 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EXTL1Q92935 676 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM159Q96B96 161 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RY11Q96G91 374 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO19Q96H55 970 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIC6Q96NY7 704 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB11Q96P15 392 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM129BQ96TA1 746 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 BACH2Q9BYV9 841 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MTG2Q9H4K7 406 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 M0QYT0 321 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC31A1O15431 190 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EFSO43281 561 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 STX10O60499 249 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 APOEP02649 317 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SETSIPP0DME0 302 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CR2P20023 1033 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CD82P27701 267 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NOS2P35228 1153 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD13P35453 343 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RABIFP47224 123 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
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PGGT1B-201ENST00000296642 ADIGQ0VDE8 80 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MTA1Q13330 715 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MORC3Q14149 939 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN3Q16667 212 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP135Q66GS9 1140 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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PGGT1B-201ENST00000296642 ATCAYQ86WG3 371 aa8.11□□□□□ -1.11
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PGGT1B-201ENST00000296642 SCML4Q8N228 414 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 IRGQQ8WZA9 623 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 EDEM1Q92611 657 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRN2Q92932 1015 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ARRDC3Q96B67 414 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMX3Q96JJ7 454 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM74Q96NL1 305 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TWNKQ96RR1 684 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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PGGT1B-201ENST00000296642 DACH1Q9UI36 760 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIC4Q9Y696 253 aa8.11□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQU0 124 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf142B7Z368 130 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 F5H5T6 163 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PDXKO00764 312 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK13O15264 365 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP9O43315 295 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 RTN2O75298 545 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH8O95206 1070 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 CSF2P04141 144 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM87AP0C7U9 286 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 TGM2P21980 687 aa8.1□□□□□ -1.11
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A2P31639 672 aa8.1□□□□□ -1.11
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