RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CNGA2Q16280 664 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPUQ71F23 418 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRPQ86YL5 185 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PASD1Q8IV76 773 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 YAF2Q8IY57 180 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MEIOBQ8N635 442 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SGSM3Q96HU1 749 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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SMARCE1-201ENST00000264640 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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SMARCE1-201ENST00000264640 ACP6Q9NPH0 428 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CISHQ9NSE2 258 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MTRRQ9UBK8 725 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 OBSL1O75147 1896 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.27□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 GON4LQ3T8J9 2241 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGESO14684 152 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LIASO43766 372 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5HO75947 161 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF8O76064 485 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC24AO95486 1093 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPNS1P04632 268 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MCF2P10911 925 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CD19P15391 556 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMA2P25787 234 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 IVDP26440 423 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC8A1P32418 973 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK8P45983 427 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO1A2P46721 670 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MNAT1P51948 309 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC18A1P54219 525 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL4CP56559 192 aa7.26□□□□□ -1.25
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SMARCE1-201ENST00000264640 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ROR1Q01973 937 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TNK2Q07912 1038 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAPQ12770 1279 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TFDP2Q14188 446 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RASA2Q15283 850 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 KYNUQ16719 465 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 P3H1Q32P28 736 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ICE2Q659A1 982 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C4orf22Q6V702 233 aa7.26□□□□□ -1.25
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SMARCE1-201ENST00000264640 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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SMARCE1-201ENST00000264640 HACE1Q8IYU2 909 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ALLCQ8N6M5 410 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MDM1Q8TC05 714 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 CRELD1Q96HD1 420 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEB18Q96M61 343 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 MCEEQ96PE7 176 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.26□□□□□ -1.25
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