RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047349.7

Usp28-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp28, Length 4,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28-201ENSMUST00000047349 Actrt1Q9D9J3 376 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Tsga13Q9DA17 273 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Tmbim4Q9DA39 238 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Il20Q9JKV9 176 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Rtl9Q32KG4 1339 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Ism2D3Z6A3 493 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Chil3O35744 398 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Cyp2b10P12791 500 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 GemP55041 295 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Mc4rP56450 332 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Brms1lQ3U1T3 323 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 UrgcpQ5NCI0 926 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Xlr3cQ61806 226 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Sh3gl3Q62421 347 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 ScapQ6GQT6 1276 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Q6GQU0 248 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Ubxn7Q6P5G6 467 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Znf821Q6PD05 413 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Olfr867Q7TRF3 331 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Dnajc16Q80TN4 772 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Kctd13Q8BGV7 329 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 BoraQ8BS90 525 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Acad10Q8K370 1069 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Caap1Q8VDY9 356 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Clca1Q9D7Z6 913 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Ccr10Q9JL21 362 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Ap1m2Q9WVP1 423 aa9.49□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Fgf10O35565 209 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 AvilO88398 819 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Kir3dl1P83555 432 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 MylpfP97457 169 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Fam171bQ14CH0 825 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Htr1aQ64264 421 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Dusp16Q6PCP3 660 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Adprhl2Q8CG72 370 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Pcdhb13Q91Y06 796 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Slc13a3Q91Y63 600 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 MrgpreQ91ZB7 310 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Anxa13Q99JG3 317 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Ndufa13Q9ERS2 144 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Pappa2E9PZ87 1789 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Fam166bA2AIP0 273 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Rad51ap2G3UW63 976 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Slc10a3P21129 473 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 OsbpQ3B7Z2 805 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Kcna4Q61423 654 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Reps2Q80XA6 521 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Clec2eQ80XD9 204 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Ston2Q8BZ60 895 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 NeproQ8R2U2 564 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Olfr1494Q8VGP8 315 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 CenpsQ9D084 142 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Olfr711Q9EPG2 314 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Nphs1Q9QZS7 1256 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Apobec2Q9WV35 224 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 XntrpcF8VQM8 1264 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Gm20509G3UZF1 325 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Cldn5O54942 218 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 PuraP42669 321 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 PrlrQ08501 608 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Nxpe4Q52KP5 543 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Itih3Q61704 889 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Rad9bQ6WBX7 403 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Arhgap11aQ80Y19 987 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 GnsQ8BFR4 544 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Prr33Q8C494 260 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Zbtb6Q8K088 423 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Nudt8Q9CR24 210 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Rfc5Q9D0F6 339 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 HemgnQ9ERZ0 503 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Syt5Q9R0N5 386 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Tle6Q9WVB3 581 aa9.48□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Olfr1160A2AVT0 319 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Zfp963D3Z2T8 383 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 BC024978J3QPC3 361 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Vmn2r67K7N6T2 851 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Klrb1bP27812 223 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 FynP39688 537 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Slc11a2P49282 568 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 TceancQ3US16 359 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 P3h1Q3V1T4 739 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Itm2aQ61500 263 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Alkbh8Q80Y20 664 aa9.47□□□□□ -0.89
Usp28-201ENSMUST00000047349 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.1 ms