RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621161.4

RAB11FIP4-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 8,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RIPK1Q13546 671 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.19■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ATP6V1G2O95670 118 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L15C9J2P7 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L11C9JVI0 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L18D6R9N7 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L22D6RA61 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L19D6RCP7 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L20D6RJB6 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L24Q0WX57 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF621Q6ZSS3 439 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MREGQ8N565 214 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZBTB22O15209 634 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DHRS7Q9Y394 339 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PLIN3O60664 434 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MAPK9P45984 424 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ITSN1Q15811 1721 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF221Q9UK13 617 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AIPO00170 330 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC1A6P48664 564 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AMPD2Q01433 879 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TCEA2Q15560 299 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HKDC1Q2TB90 917 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP17L5A8MUK1 530 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CES2O00748 559 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BMP7P18075 431 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SPIDRQ14159 915 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RNF146Q9NTX7 359 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.18■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KCNH1O95259 989 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ODC1P11926 461 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RAG1P15918 1043 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NFKB1P19838 968 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 USP46P62068 366 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PPP2R2BQ00005 443 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FATE1Q969F0 183 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PSME2Q9UL46 239 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AFF2P51816 1311 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 DLG3Q92796 817 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MCIDASD6RGH6 385 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TRIM38O00635 465 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SMIM11AP58511 58 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FAM187BQ17R55 369 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OAFQ86UD1 273 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TDRPQ86YL5 185 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ASB12Q8WXK4 309 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BTBD19C9JJ37 291 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PAX7P23759 505 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CLTCL1P53675 1640 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MUTP22033 750 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RPL4P36578 427 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TMEM159Q96B96 161 aa20.17■□□□□ 0.82
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms