RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF605Q86T29 641 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 WDR49Q8IV35 697 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MCFD2Q8NI22 146 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PDCD10Q9BUL8 212 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SP140LQ9H930 580 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 OSGEPQ9NPF4 335 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GRIN2DO15399 1336 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 VWDEQ8N2E2 1590 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AGPSO00116 658 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 OGTO15294 1046 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MYBP10242 640 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CYP2C9P11712 490 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ANO7Q6IWH7 933 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PKN3Q6P5Z2 889 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MPZL3Q6UWV2 235 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HERC6Q8IVU3 1022 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AHI1Q8N157 1196 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HM13Q8TCT9 377 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ASB2Q96Q27 587 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCSER2Q9H7U1 834 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC42Q9Y546 428 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEB16A2A368 324 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AXIN1O15169 862 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 GUCA1CO95843 209 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 IFNA16P05015 189 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ETS1P14921 441 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TPTEP56180 551 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 COPZ1P61923 177 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 COBLL1Q53SF7 1204 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FAM83AQ86UY5 434 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ECHDC2Q86YB7 292 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FITM2Q8N6M3 262 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SMYD1Q8NB12 490 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RNF145Q96MT1 663 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CDH19Q9H159 772 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SPAG4Q9NPE6 437 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 KANSL3Q9P2N6 904 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 POLG2Q9UHN1 485 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PKP3Q9Y446 797 aa7□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SUPT7LO94864 414 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TGFB3P10600 412 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TGM2P21980 687 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SOX11P35716 441 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CAP2P40123 477 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RENBPP51606 427 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SZRD1Q7Z422 152 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C4orf19Q8IY42 314 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 EMC1Q8N766 993 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ITFG1Q8TB96 612 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 TLCD1Q96CP7 247 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HPDLQ96IR7 371 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SEPHS2Q99611 448 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CAPN10Q9HC96 672 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CD274Q9NZQ7 290 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 USP20Q9Y2K6 914 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ACOT9Q9Y305 439 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC154A6NI56 674 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 HAT1O14929 419 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 SQLEQ14534 574 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 NFIL3Q16649 462 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 C11orf74Q86VG3 221 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MIER2Q8N344 545 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF276Q8N554 614 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 UCMAQ8WVF2 138 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 IL25Q9H293 177 aa6.99□□□□□ -1.29
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms