RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610369.4

TARDBP-211, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-211ENST00000610369 C1orf74Q96LT6 269 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 GBP4Q96PP9 640 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 FAM129BQ96TA1 746 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 NPY6RQ99463 290 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 OMDQ99983 421 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 COX16Q9P0S2 106 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 WASF3Q9UPY6 502 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.97□□□□□ -0.81
TARDBP-211ENST00000610369 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ATP9BO43861 1147 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SH3BP5O60239 455 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 PROS1P07225 676 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 PDGFRAP16234 1089 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 GALCP54803 685 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 KRT83P78385 493 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 NAXDQ8IW45 347 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 PTPRN2Q92932 1015 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 IGSF8Q969P0 613 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SPAG5Q96R06 1193 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CDC6Q99741 560 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SIK2Q9H0K1 926 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 MTG2Q9H4K7 406 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 VPS28Q9UK41 221 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.96□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 A0A1B0GVT2 93 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 A0A1W2PP55 124 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 A0A1W2PPC4 97 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 DRGXA6NNA5 263 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 F8VZ95 297 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ALOX15BO15296 676 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 MID1O15344 667 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 FLRT2O43155 660 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 IL1BP01584 269 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 NUDT1P36639 197 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SULT1E1P49888 294 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CCR5P51681 352 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 C21orf59P57076 290 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 DEUP1Q05D60 604 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ACCSLQ4AC99 568 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 GLRX5Q86SX6 157 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 XYLT1Q86Y38 959 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 STK40Q8N2I9 435 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ALG14Q96F25 216 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 CCDC114Q96M63 670 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 HAPLN3Q96S86 360 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 MUC3BQ9H195 1237 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 VPS16Q9H269 839 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 PIGVQ9NUD9 493 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 ANO10Q9NW15 660 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 PI4KAP42356 2102 aa9.95□□□□□ -0.82
TARDBP-211ENST00000610369 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms