RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CLIC5Q9NZA1 410 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 AMACRQ9UHK6 382 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 STRIP2Q9ULQ0 834 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 E2F8A0AVK6 867 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM196Q5HYL7 178 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PBKQ96KB5 322 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CENPOQ9BU64 300 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEB5Q9BZ81 275 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TPSD1Q9BZJ3 242 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 EPN3Q9H201 632 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 COL4A2P08572 1712 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 K7EQS6 105 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 KRIT1O00522 736 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DCLK1O15075 740 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 KAT7O95251 611 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 13
RABGEF1-209ENST00000607882 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBP50607 506 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS24P62847 133 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FMO1Q01740 532 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CDO1Q16878 200 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DAAM2Q86T65 1068 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FRMD1Q8N878 549 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 WFDC5Q8TCV5 224 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTRT1Q8TDG2 376 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF34Q969K3 372 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A17Q9H1V8 727 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCC13Q9NSE7 274 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD54BQ9Y620 910 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PRRT4C9JH25 899 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CES2O00748 559 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 H2AFZP0C0S5 128 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A4P31645 630 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MDH1P40925 334 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FNTBP49356 437 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 JAM2P57087 298 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP11AP98196 1134 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 NR1H3Q13133 447 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CUL1Q13616 776 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 H2AFVQ71UI9 128 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS36Q86VN1 386 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HSFY1Q96LI6 401 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DDIT4Q9NX09 232 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP69A5D8W1 941 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.92□□□□□ -0.349e-7■□□□□ 10
RABGEF1-209ENST00000607882 DAPK3O43293 454 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA0754O94854 1291 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ADH1CP00326 375 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 MYZAPP0CAP1 466 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SP9P0CG40 484 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKCIP41743 596 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TBX4P57082 545 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 COG7P83436 770 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC6Q16204 474 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TRNP1Q6NT89 227 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HTR3DQ70Z44 454 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM110Q86TL2 294 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ERICH1Q86X53 443 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 DCLK2Q8N568 766 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 RLN3Q8WXF3 142 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CLDN23Q96B33 292 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM122AQ96E09 287 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 SIK2Q9H0K1 926 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TMBIM4Q9HC24 238 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ANLNQ9NQW6 1124 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ZMYM5Q9UJ78 669 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 E7EVH7 732 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 STAT1P42224 750 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 HARS2P49590 506 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 STILQ15468 1287 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 GEN1Q17RS7 908 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 NADSYN1Q6IA69 706 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 ANO7Q6IWH7 933 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 OLFML1Q6UWY5 402 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZNB5 142 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 NLRP14Q86W24 1093 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CCT8L2Q96SF2 557 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRDQ9H2X0 955 aa12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms