RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602479.5

UBE2E3-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E3, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-206ENST00000602479 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 NUMBP49757 651 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC6A3Q01959 620 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 KIF19Q2TAC6 998 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 VWA3BQ502W6 1294 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 FBXL22Q6P050 247 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 LAYNQ6UX15 382 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 GANCQ8TET4 914 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 PTPRN2Q92932 1015 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 RNF34Q969K3 372 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 IGSF8Q969P0 613 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 FZD4Q9ULV1 537 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 LAMA5O15230 3695 aa22.39■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.39■■□□□ 1.18
UBE2E3-206ENST00000602479 A0A1W2PP55 124 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 C10orf142B7Z368 130 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 IRAK1P51617 712 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 PLK1P53350 603 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 GALCP54803 685 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NME3Q13232 169 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 TEAD4Q15561 434 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 GLRX5Q86SX6 157 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 AADATQ8N5Z0 425 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SYNCQ9H7C4 482 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 VAV1P15498 845 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC8A1P32418 973 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NOS2P35228 1153 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 GGCXP38435 758 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 PSMD8P48556 350 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SNX16P57768 344 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 MTA1Q13330 715 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 STK40Q8N2I9 435 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ALG14Q96F25 216 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 PIGVQ9NUD9 493 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 DACH1Q9UI36 760 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 M0QYT0 321 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 FLRT2O43155 660 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 PAGE1O75459 146 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ADH1BP00325 375 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 OXCT1P55809 520 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 BPIFB4P59827 614 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SULT2A1Q06520 285 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 KCNMA1Q12791 1236 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 FRS2Q8WU20 508 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NPY6RQ99463 290 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 OMDQ99983 421 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 A0A1W2PPC4 97 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NNMTP40261 264 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 CTSKP43235 329 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 KCNJ12Q14500 433 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 C5orf22Q49AR2 442 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 NT5C3BQ969T7 300 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 EBF2Q9HAK2 575 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 RRN3Q9NYV6 651 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-206ENST00000602479 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 306.8 ms