RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	SLC8A1	P32418	973 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	DRD3	P35462	400 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	GGCX	P38435	758 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	PPP1R2	P41236	205 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ACADSB	P45954	432 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CLDN6	P56747	220 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ECT2L	Q008S8	904 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CENPC	Q03188	943 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	PDCL	Q13371	301 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CAMK2B	Q13554	666 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	DHRS13	Q6UX07	377 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM110	Q86TL2	294 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	KDM1B	Q8NB78	822 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	STK32A	Q8WU08	396 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	OMD	Q99983	421 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	FZD4	Q9ULV1	537 aa		12.5	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1W2PR77	199 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	C21orf59	P57076	290 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	UBE2H	P62256	183 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	MEA1	Q16626	185 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	PASD1	Q8IV76	773 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	FRS2	Q8WU20	508 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CPXM1	Q96SM3	734 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	THAP9	Q9H5L6	903 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	COX16	Q9P0S2	106 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	MYLK	Q15746	1914 aa		12.49	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422		F5H5T6	163 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	MED7	O43513	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	GRAP2	O75791	330 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	MOCS3	O95396	460 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	GNA14	O95837	355 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	GOT1	P17174	413 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SLC9A1	P19634	815 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	C5AR1	P21730	350 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CCR5	P51681	352 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CYP4F3	Q08477	520 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ALG14	Q96F25	216 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	MED15	Q96RN5	788 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	DDIT4	Q9NX09	232 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SARDH	Q9UL12	918 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	BPTF	Q12830	3046 aa		12.48	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1B0GVM2	712 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	LAT	O43561	262 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	RTN2	O75298	545 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ADH1B	P00325	375 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	IL1B	P01584	269 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ERBB2	P04626	1255 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	CD38	P28907	300 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	USP8	P40818	1118 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJC3	Q13217	504 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	FBXL22	Q6P050	247 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	DEFB106A	Q8N104	65 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		12.47	□□□□□ -0.41
CTIF-208	ENST00000590422	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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