RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NUP205	Q92621	2012 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934		A0A0D9SEW6	157 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TRIM24	O15164	1050 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	DAPK3	O43293	454 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NFATC1	O95644	943 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PEX11B	O96011	259 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ADH5	P11766	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	HLA-F	P30511	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	OPRD1	P41143	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CETN2	P41208	172 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NR2C2	P49116	596 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	DYNLT1	P63172	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GAD2	Q05329	585 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	IER5L	Q5T953	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	BHMT	Q93088	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CD160	O95971	181 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ADH1C	P00326	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CYBB	P04839	570 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	OR1E1	P30953	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CD70	P32970	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GJA4	P35212	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ACVRL1	P37023	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SLC6A11	P48066	632 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GNA12	Q03113	381 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	LMAN2	Q12907	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SERINC3	Q13530	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CCNG2	Q16589	344 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM215	Q68D42	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RASA4B	C9J798	803 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	RASA4	O43374	803 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	LIAS	O43766	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MAFK	O60675	156 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TULP3	O75386	442 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	XRCC4	Q13426	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	TDG	Q13569	410 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ANO4	Q32M45	955 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	PARP15	Q460N3	678 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	MFN1	Q8IWA4	741 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APBA3-204	ENST00000589934	APCDD1	Q8J025	514 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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