RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A13Q96QE2 648 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP12Q9UNI6 340 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD54BQ9Y620 910 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TKTP29401 623 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1D2P34982 312 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL4AP40617 200 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 MSH2P43246 934 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CA9Q16790 459 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB6CQ53S08 254 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 FERMT1Q9BQL6 677 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB6CQ9H0N0 254 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PIEZO1Q92508 2521 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 I3L4J1 428 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TYROBPO43914 113 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 LCP1P13796 627 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXA9P31269 272 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 LIG3P49916 1009 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN5P54829 565 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ADCY1Q08828 1119 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKMY2Q8IV38 441 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 FBF1Q8TES7 1133 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CSPG4P5Q96PW8 444 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 NPY6RQ99463 290 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PAFAH2Q99487 392 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB6BQ9NRW1 208 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ETNK2Q9NVF9 386 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 FZD10Q9ULW2 581 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 USP3Q9Y6I4 520 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TM9SF1O15321 606 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 C8AP07357 584 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMP2P13473 410 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 RBL1P28749 1068 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NUBP1P53384 320 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF180Q9UJW8 692 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD65E5RJM6 399 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BRJ5 948 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 FDFT1P37268 417 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC14Q15048 493 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NUGGCQ68CJ6 796 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKS3Q6ZW76 656 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CYS1Q717R9 158 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 MGARPQ8TDB4 240 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 MZB1Q8WU39 189 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NTAN1Q96AB6 310 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 OLFM3Q96PB7 478 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH9Q9ULB4 789 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 HEY1Q9Y5J3 304 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CDY1Q9Y6F8 540 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D4O60343 1298 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 POU2F2P09086 479 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM200BP0CF97 657 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 MLNP12872 115 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TAC1P20366 129 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SSTR1P30872 391 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ELK3P41970 407 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEA3P43357 314 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR4P57081 412 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SARNPP82979 210 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PDK4Q16654 411 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PPM1LQ5SGD2 360 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA21Q7Z572 469 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB106AQ8N104 65 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SCML4Q8N228 414 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAKDQ8WVC6 231 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC44A1Q8WWI5 657 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NXPE3Q969Y0 559 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SENP8Q96LD8 212 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PHOX2BQ99453 314 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 HAUS2Q9NVX0 235 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 STARD13Q9Y3M8 1113 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 ANHXE9PGG2 379 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1E1P49888 294 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA5AQ13591 1074 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 PAQR9Q6ZVX9 377 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-204ENST00000587718 RTL10Q7L3V2 364 aa26.11■■□□□ 1.77
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