RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL17RCQ8NAC3 791 aa34.03■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC17Q96AE7 1141 aa34.02■■■■□ 3.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP17Q9ULZ9 603 aa34■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa33.99■■■■□ 3.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDFIP2Q9NV92 336 aa33.99■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0U1RQJ8 604 aa33.99■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BRJ5 948 aa33.98■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SULT2A1Q06520 285 aa33.98■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT86O43790 486 aa33.97■■■■□ 3.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF234Q14588 700 aa33.97■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf42Q9NWW7 574 aa33.96■■■■□ 3.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa33.96■■■■□ 3.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM23O75077 832 aa33.95■■■■□ 3.03
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