RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557341.5

SNX6-210, Transcript of sorting nexin 6, humanhuman

TSL 5

Gene SNX6, Length 559 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6-210ENST00000557341 BPIFB4P59827 614 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SLC6A3Q01959 620 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 CENPCQ03188 943 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SULT2A1Q06520 285 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 NME3Q13232 169 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 MIIPQ5JXC2 388 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 GLRX5Q86SX6 157 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 OMDQ99983 421 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 LRRC72A6NJI9 287 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 M0QYT0 321 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 CBFA2T3O75081 653 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SLC8A1P32418 973 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 NOS2P35228 1153 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 NUMBP49757 651 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PLK1P53350 603 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 KIF19Q2TAC6 998 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 FBXL22Q6P050 247 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 LAYNQ6UX15 382 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PTPRN2Q92932 1015 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 IGSF8Q969P0 613 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 RRN3Q9NYV6 651 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 A0A1W2PPC4 97 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 IL1BP01584 269 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 C5AR1P21730 350 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 GGCXP38435 758 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 CCT8P50990 548 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 GALCP54803 685 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 KCNJ12Q14500 433 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 STK40Q8N2I9 435 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 AADATQ8N5Z0 425 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 SPAG5Q96R06 1193 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.58□□□□□ -0.07
SNX6-210ENST00000557341 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 PAGE1O75459 146 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 CLDN11O75508 207 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 VAV1P15498 845 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 CYP11B1P15538 503 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 GOT1P17174 413 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 SCNN1AP37088 669 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 SULT1E1P49888 294 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 IRAK1P51617 712 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 ADPRHP54922 357 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 C21orf59P57076 290 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX6-210ENST00000557341 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms