RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	NPAS1	Q99742	590 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KLRK1	P26718	216 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MLH1	P40692	756 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KCNJ4	P48050	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CDK7	P50613	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MAF1	Q9H063	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	LARGE1	O95461	756 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXC6	P09630	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TGFB3	P10600	412 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	GRK5	P34947	590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	STAT1	P42224	750 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	LTB	Q06643	244 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PMPCA	Q10713	525 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	NBN	O60934	754 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ARSB	P15848	533 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC16A2	P36021	539 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	BTK	Q06187	659 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007		Q0VFX4	171 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KEAP1	Q14145	624 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	GALNT3	Q14435	633 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ASIC2	Q16515	512 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	MYD88	Q99836	296 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TIMM9-208	ENST00000556007	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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