RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 RNF14Q9UBS8 474 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 NUP205Q92621 2012 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 A0A0D9SEW6 157 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PHF2O75151 1096 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ASGR2P07307 311 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CHKAP35790 457 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CETN2P41208 172 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PAFAH1B1P43034 410 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 IFNAR2P48551 515 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CDH4P55283 916 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GALNT2Q10471 571 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TUBB2AQ13885 445 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 AAK1Q2M2I8 961 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MPPE1Q53F39 396 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 OR7D4Q8NG98 312 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TTC8Q8TAM2 541 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 DDI1Q8WTU0 396 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 OTUB2Q96DC9 234 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 HMCESQ96FZ2 354 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 LGMNQ99538 433 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 BBS2Q9BXC9 721 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MARK1Q9P0L2 795 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 COL4A2P08572 1712 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 RASA4BC9J798 803 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 DFFAO00273 331 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 RASA4O43374 803 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CLDN11O75508 207 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PEX11BO96011 259 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 RBP3P10745 1247 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TYRP14679 529 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PSMC3P17980 439 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GLDCP23378 1020 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 HLA-FP30511 346 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 OR1E1P30953 314 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GDI1P31150 447 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CD70P32970 193 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CSKP41240 450 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PTGIRP43119 386 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MAPKAPK2P49137 400 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GDF10P55107 478 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 LMAN2Q12907 356 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 CCNG2Q16589 344 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ANO4Q32M45 955 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MPP7Q5T2T1 576 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 IER5LQ5T953 404 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MTSS1LQ765P7 747 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 MFN1Q8IWA4 741 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 NAT16Q8N8M0 369 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 P3H4Q92791 437 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ALG14Q96F25 216 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.072e-6■■□□□ 13.5
CS-216ENST00000549221 KRT12Q99456 494 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 ECT2Q9H8V3 914 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-216ENST00000549221 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.35□□□□□ -1.07
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