RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TLE6	Q9H808	572 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SCN1A	P35498	2009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266		A8MXQ7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RFXAP	O00287	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNK3	O14649	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PRRG1	O14668	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TACC1	O75410	805 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OAZ2	O95190	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GLUD1	P00367	558 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TPM1	P09493	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KRT5	P13647	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FOSL2	P15408	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PI3	P19957	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DNAJB1	P25685	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PON1	P27169	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	ELF1	P32519	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	OR1D2	P34982	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	USP8	P40818	1118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NRIP1	P48552	1158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	EPHA5	P54756	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MFAP3	P55082	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GSDMD	P57764	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LINC00310	P59036	64 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM193A	P78312	1265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	GCNT1	Q02742	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266		Q7L0L9	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNHG1-208	ENST00000538266	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms