RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533198.1

DDX10-205, Transcript of DEAD-box helicase 10, human

TSL 3

Gene DDX10, Length 372 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX10-205	ENST00000533198	MC1R	Q01726	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ITIH3	Q06033	890 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	NELL1	Q92832	810 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PERP	Q96FX8	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SPDEF	O95238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	METTL18	O95568	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PRPH2	P23942	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ITPKB	P27987	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CTGF	P29279	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ACSL1	P33121	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PSG6	Q00889	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PER2	O15055	1255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ONECUT2	O95948	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PEX11B	O96011	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	C1R	P00736	705 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ADRB2	P07550	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CHRM2	P08172	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CSH1	P0DML2	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CSH2	P0DML3	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	COX7A2	P14406	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	CD72	P21854	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	NR4A1	P22736	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TM4SF1	P30408	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ADRA1B	P35368	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	DIO1	P49895	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	AGTR2	P50052	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TPTE	P56180	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	GPC5	P78333	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TSPY1	Q01534	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MED22	Q15528	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	HAS1	Q92839	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDX10-205	ENST00000533198	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms