RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 THAP2Q9H0W7 228 aa22.58■■□□□ 1.21
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PTPRK-222ENST00000532751 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 CD248Q9HCU0 757 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRK-222ENST00000532751 HLA-EP13747 358 aa22.57■■□□□ 1.2
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PTPRK-222ENST00000532751 MYO19Q96H55 970 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTPRK-222ENST00000532751 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.55■■□□□ 1.2
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PTPRK-222ENST00000532751 OR52K2Q8NGK3 314 aa22.54■■□□□ 1.2
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PTPRK-222ENST00000532751 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 LOXL4Q96JB6 756 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRK-222ENST00000532751 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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