RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 EBF2Q9HAK2 575 aa24.78■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 ACP6Q9NPH0 428 aa24.78■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.78■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 CEP83Q9Y592 693 aa24.78■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 KNTC1P50748 2209 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 ADAMTS20P59510 1910 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 A0A1B0GTQ1 180 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 A0A1B0GVM2 712 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 CCR1P32246 355 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 NNMTP40261 264 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 C21orf59P57076 290 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 KCNJ12Q14500 433 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 SHC3Q92529 594 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 APC2O95996 2303 aa24.77■■□□□ 1.56
ACER3-211ENST00000531461 KCNK3O14649 394 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 HSF2BPO75031 334 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ABCB4P21439 1286 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CDK17Q00537 523 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 TAF5Q15542 800 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 STK40Q8N2I9 435 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 AADATQ8N5Z0 425 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SLC6A18Q96N87 628 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CPXM1Q96SM3 734 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 LHX6Q9UPM6 363 aa24.76■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SLC9A1P19634 815 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CD38P28907 300 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ADPRHP54922 357 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 GJB7Q6PEY0 223 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 GBP6Q6ZN66 633 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 DEFB106AQ8N104 65 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 FRS2Q8WU20 508 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SPAG5Q96R06 1193 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.75■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PR77 199 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 YKT6O15498 198 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 LATO43561 262 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 WNT1P04628 370 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PDGFRAP16234 1089 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PSMD8P48556 350 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ALG14Q96F25 216 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 NOX5Q96PH1 765 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 DDIT4Q9NX09 232 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.74■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SLC7A4O43246 635 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 DRD3P35462 400 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SNX16P57768 344 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 FBXL22Q6P050 247 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ATRXP46100 2492 aa24.73■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ATP9BO43861 1147 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 IL1BP01584 269 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PON1P27169 355 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 NUDT1P36639 197 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 PTK2Q05397 1052 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 C5orf22Q49AR2 442 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.72■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ITPR1Q14643 2758 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ALOX15BO15296 676 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 USP8P40818 1118 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CAMK2BQ13554 666 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ACER3-211ENST00000531461 MDM1Q8TC05 714 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms