RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa1.1□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GXYLT2A0PJZ3 443 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP69A5D8W1 941 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ISM1B1AKI9 464 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STMND1H3BQB6 276 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0QYT0 321 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EDIL3O43854 480 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFBP2P18065 325 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGM2P21980 687 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT9P35527 623 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMP3P35625 211 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEK2P51955 445 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK11-1P61568 191 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPS1Q13098 491 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNTA1Q13424 505 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAP1GAP2Q684P5 730 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRTC1Q6UUV9 634 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYB5R4Q7L1T6 521 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM217Q8N7C4 229 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC57Q8N9N7 239 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDSUB1Q8N9V3 476 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUCLG2Q96I99 432 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRG7Q96K78 797 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AIFM3Q96NN9 605 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UHRF2Q96PU4 802 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NMRK2Q9NPI5 230 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D23Q9NUY8 699 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 L1RE1Q9UN81 338 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC8A2Q9UPR5 921 aa1.09□□□□□ -2.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VWA5AO00534 786 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMD1P17707 334 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC16A2P36021 539 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDT6P53370 316 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXL2P58012 376 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHAGQ02094 409 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYBPHQ13203 477 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYBPC2Q14324 1141 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALNT3Q14435 633 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLFQ16534 295 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALG10Q5BKT4 473 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALG10BQ5I7T1 473 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MSANTD2Q6P1R3 559 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHBDF2Q6PJF5 856 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA0408Q6ZU52 694 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH2D6Q7Z4S9 175 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPAG16Q8N0X2 631 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIGA1Q8NAN2 632 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEK9Q8TD19 979 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MSLNLQ96KJ4 702 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX22Q96L94 193 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A33Q9BSK2 321 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCTN5Q9BTE1 182 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNK9Q9NPC2 374 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF212Q9UDV6 495 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MALT1Q9UDY8 824 aa1.08□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMTK3Q96Q04 1460 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2W5A6NFC9 320 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNJ18B7U540 433 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 P2RY10O00398 339 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MSI1O43347 362 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A3O75751 556 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INMTO95050 263 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN7O95471 211 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYF5P13349 255 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT5P13647 590 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA6P17066 643 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCAM1P19320 739 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP8P22894 467 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DGKAP23743 735 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AVPR1AP37288 418 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNJ4P48050 445 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MXI1P50539 228 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSCR10P59022 87 aa1.07□□□□□ -2.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCL1Q07820 350 aa1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms