RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 E7EVH7 732 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DFFAO00273 331 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MUSKO15146 869 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 COCHO43405 550 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GLDCP23378 1020 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 YWHAQP27348 245 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DSG1Q02413 1049 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 BMPR2Q13873 1038 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 IKBKEQ14164 716 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PPP2R5DQ14738 602 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 STEAP4Q687X5 459 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MON1AQ86VX9 555 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MCUQ8NE86 351 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GKN1Q9NS71 199 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CFAP69A5D8W1 941 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GOLGA8RI6L899 631 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CSPG5O95196 566 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 F9P00740 461 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SOD2P04179 222 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PRKCGP05129 697 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PRKCHP24723 683 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CCR1P32246 355 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ACVRL1P37023 503 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 IFNAR2P48551 515 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TUBP50607 506 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TBX4P57082 545 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 STAT4Q14765 748 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGEF6Q15052 776 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZSCAN26Q16670 478 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GDAP1Q8TB36 358 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 AZIN2Q96A70 460 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HMCESQ96FZ2 354 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 EPN3Q9H201 632 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GBA3Q9H227 469 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RRN3Q9NYV6 651 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC12A8A0AV02 714 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM159BA6NKW6 160 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 WASH4PA8MWX3 477 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 JCHAINP01591 159 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TPH1P17752 444 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CHRNA4P43681 627 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ABCG1P45844 678 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CCT5P48643 541 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PDK1Q15118 436 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 USP41Q3LFD5 358 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC8BQ6P9F7 803 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 VPS52Q8N1B4 723 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC44A1Q8WWI5 657 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RNF34Q969K3 372 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TEKT5Q96M29 485 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM14Q96QK8 99 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 IL12RB2Q99665 862 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC3Q9BY71 257 aa4.94□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 IL21Q9HBE4 155 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms