RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 RHOCP08134 193 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SP100P23497 879 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 PLK1P53350 603 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TDGQ13569 410 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 PDK1Q15118 436 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 MNS1Q8NEH6 495 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 FATE1Q969F0 183 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 FERMT1Q9BQL6 677 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 HEMGNQ9BXL5 484 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 LRRC19Q9H756 370 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 MRFAP1Q9Y605 127 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 MCF2LO15068 1137 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SRFP11831 508 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ARSAP15289 507 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SGSHP51688 502 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 GNA12Q03113 381 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 GALNT2Q10471 571 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TRIM68Q6AZZ1 485 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 AADACL2Q6P093 401 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ACDQ96AP0 544 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 HDAC11Q96DB2 347 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 OLFM3Q96PB7 478 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ASB2Q96Q27 587 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 KLC2Q9H0B6 622 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DTLQ9NZJ0 730 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CFAP69A5D8W1 941 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 KRIT1O00522 736 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ZNF185O15231 689 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 MTSS1O43312 755 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 MFSD11O43934 449 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 GJA4P35212 333 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 IRAK1P51617 712 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DYNLT1P63172 113 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SULT2A1Q06520 285 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 NOMO1Q15155 1222 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CCNG2Q16589 344 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CYP1B1Q16678 543 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 AHI1Q8N157 1196 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CEP112Q8N8E3 955 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DCAF4L2Q8NA75 395 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 ACTL9Q8TC94 416 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TSGA13Q96PP4 275 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 HAUS2Q9NVX0 235 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DEC1Q9P2X7 70 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SORCS3Q9UPU3 1222 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 RASA4BC9J798 803 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 RASA4O43374 803 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TIMM44O43615 452 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 BMP1P13497 986 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CCNCP24863 283 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 CHRNA3P32297 505 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 GARSP41250 739 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 FNTAP49354 379 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 DGKGP49619 791 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 VASPP50552 380 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 LMNB2Q03252 620 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 GBE1Q04446 702 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 TNK2Q07912 1038 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-208ENST00000481211 SLC20A2Q08357 652 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms