RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	CAPN3	P20807	821 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	GALNS	P34059	522 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	OAZ1	P54368	228 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	FOXL2	P58012	376 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	APOPT1	Q96IL0	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TRIM2	Q9C040	744 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	VEZT	Q9HBM0	779 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	AASS	Q9UDR5	926 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541		H0YIZ8	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	GRM8	O00222	908 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TBX18	O95935	607 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	LDHC	P07864	332 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CHM	P24386	653 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	RPS6KA3	P51812	740 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	PSG6	Q00889	435 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CDK18	Q07002	472 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	LRRC24	Q50LG9	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF366	Q8N895	744 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC17	Q96LX7	622 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	HSF4	Q9ULV5	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	LRP5	O75197	1615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	EP400	Q96L91	3159 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	HECW1	Q76N89	1606 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ZBED4	O75132	1171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	METTL18	O95568	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	MT-CO3	P00414	261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CSF1	P09603	554 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ELFN1	P0C7U0	828 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ACP5	P13686	325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	IGFBP2	P18065	325 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	AGTR2	P50052	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	GALNT2	Q10471	571 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	SEC23B	Q15437	767 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	LAS2	Q8IYD9	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TERB1	Q8NA31	727 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	NCSTN	Q92542	709 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	KCNJ9	Q92806	393 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	MASTL	Q96GX5	879 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	CLPB	Q9H078	707 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	THAP1	Q9NVV9	213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RNF216-208	ENST00000479541	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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