RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474040.5

HOXB-AS3-206, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 741 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NOMO1Q15155 1222 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PARP15Q460N3 678 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC181Q5TID7 509 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 P3H4Q92791 437 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LMLNQ96KR4 655 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 OLFM3Q96PB7 478 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NCAM2O15394 837 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RAMP2O60895 175 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NR1H3Q13133 447 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 XRCC4Q13426 336 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CDH18Q13634 790 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCNG2Q16589 344 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CYP1B1Q16678 543 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANO4Q32M45 955 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FSCBQ5H9T9 825 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NPNTQ6UXI9 565 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MFN1Q8IWA4 741 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PRELID2Q8N945 189 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ACTL9Q8TC94 416 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DNASE1L2Q92874 299 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BHMTQ93088 406 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MAGEH1Q9H213 219 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BRD9Q9H8M2 597 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLK2Q9NYY3 685 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COL4A2P08572 1712 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 H0Y626 953 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KRIT1O00522 736 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RHOCP08134 193 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MX2P20592 715 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ETFBP38117 255 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLK1P53350 603 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GNA12Q03113 381 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF33AQ06730 810 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC12A1Q13621 1099 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ALG14Q96F25 216 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TSGA13Q96PP4 275 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C5orf42Q9H799 3197 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HACD1B0YJ81 288 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RASA4BC9J798 803 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC188H7C350 402 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RASA4O43374 803 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LIASO43766 372 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ASGR2P07307 311 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CISD3P0C7P0 127 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BMP1P13497 986 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HLA-FP30511 346 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GJA4P35212 333 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 LMAN2Q12907 356 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SERINC3Q13530 473 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TDGQ13569 410 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PDK1Q15118 436 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FATE1Q969F0 183 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HAUS1Q96CS2 278 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HDAC11Q96DB2 347 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CHFRQ96EP1 664 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms