RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 USP29Q9HBJ7 922 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 COL4A3Q01955 1670 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 NCAM2O15394 837 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 LAMP2P13473 410 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 RBL1P28749 1068 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 OR1E1P30953 314 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 SLC7A5Q01650 507 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 MPP7Q5T2T1 576 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 RTP4Q96DX8 246 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 HMCESQ96FZ2 354 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 DONSONQ9NYP3 566 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-209ENST00000470095 CFAP69A5D8W1 941 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 RASA4BC9J798 803 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 SGK1O00141 431 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 DFFAO00273 331 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 RASA4O43374 803 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 RAMP2O60895 175 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 FOSL2P15408 326 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 MX2P20592 715 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 NRLP54845 237 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 LMNB2Q03252 620 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 PTK6Q13882 451 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ELF2Q15723 593 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 MPPE1Q53F39 396 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 FYB2Q5VWT5 728 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 VITQ6UXI7 678 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 TMEM25Q86YD3 366 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 DEFB123Q8N688 67 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 TSGA13Q96PP4 275 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 MARK1Q9P0L2 795 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 A0A0D9SEW6 157 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ILVBLA1L0T0 632 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 KCNN4O15554 427 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 MBTPS2O43462 519 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 MAFKO60675 156 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 GAS8O95995 478 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 KRT14P02533 472 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 CYP17A1P05093 508 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 RHOCP08134 193 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ETS1P14921 441 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 KCNA5P22460 613 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ACVRL1P37023 503 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 GNA12Q03113 381 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 EML3Q32P44 896 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 PARP15Q460N3 678 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-209ENST00000470095 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms