RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 SMIM23A6NLE4 172 aa21.48■■□□□ 1.03
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GPC1-202ENST00000420138 MAFKO60675 156 aa21.48■■□□□ 1.03
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GPC1-202ENST00000420138 BMPR1AP36894 532 aa21.48■■□□□ 1.03
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GPC1-202ENST00000420138 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC1-202ENST00000420138 CHSY1Q86X52 802 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC1-202ENST00000420138 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC1-202ENST00000420138 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC1-202ENST00000420138 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
GPC1-202ENST00000420138 AGAP3Q96P47 875 aa21.45■■□□□ 1.02
GPC1-202ENST00000420138 NACA2Q9H009 215 aa21.45■■□□□ 1.02
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