RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CREMQ03060 361 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA5AQ13591 1074 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SPARCL1Q14515 664 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 AFMIDQ63HM1 303 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 C4orf22Q6V702 233 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF534Q76KX8 674 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CHSY1Q86X52 802 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PDIK1LQ8N165 341 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PYROXD1Q8WU10 500 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 WASH4PA8MWX3 477 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 E7EVH7 732 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ACSL4O60488 711 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 OPHN1O60890 802 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PIAS1O75925 651 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 STC2O76061 302 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 STK10O94804 968 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ADH1AP07327 375 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 C8AP07357 584 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GJA1P17302 382 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TEX44Q53QW1 395 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GAREM2Q75VX8 874 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LGI2Q8N0V4 545 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 EXOC4Q96A65 974 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC3Q9BY71 257 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM51Q9NW97 253 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 STK39Q9UEW8 545 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MAFFQ9ULX9 164 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.74■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SMAPO00193 183 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RASGRF2O14827 1237 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CCL16O15467 120 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RHOQP17081 205 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CCNCP24863 283 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 GABRR2P28476 465 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 FDFT1P37268 417 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LMAN1P49257 510 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 COG7P83436 770 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CYP4F8P98187 520 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SHHQ15465 462 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PARP6Q2NL67 630 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LZTR1Q8N653 840 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CNTD1Q8N815 330 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IRAK3Q9Y616 596 aa15.73■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LRG1P02750 347 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TPSB2P20231 275 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 SGSHP51688 502 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TPSAB1Q15661 275 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ITIH5Q86UX2 942 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 PALM2Q8IXS6 379 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 MPP5Q8N3R9 675 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HMCESQ96FZ2 354 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TSGA13Q96PP4 275 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TLR9Q9NR96 1032 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 LZTS1Q9Y250 596 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.72■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 J3KR12 359 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 TSPAN3O60637 253 aa15.71■□□□□ 0.11
CASQ1-201ENST00000368078 RFPL2O75678 378 aa15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms