RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365211.1

RNU6-1280P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1280, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1280P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1280P-201ENST00000365211 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ADGRE3Q9BY15 652 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TRIM31Q9BZY9 425 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MUC13Q9H3R2 512 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 KRT84Q9NSB2 600 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 DTX4Q9Y2E6 619 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PKP3Q9Y446 797 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 BTBD19C9JJ37 291 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MCIDASD6RGH6 385 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CLIC1O00299 241 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 FYB1O15117 783 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ORC4O43929 436 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CNTN5O94779 1100 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CCNDBP1O95273 360 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MLYCDO95822 493 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 HLA-DQA2P01906 255 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ADH4P08319 380 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ELFN1P0C7U0 828 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 LYL1P12980 280 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TGM2P21980 687 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 FPR3P25089 353 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ABCD1P33897 745 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ADRA1BP35368 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 BSGP35613 385 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ARL3P36405 182 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MLH1P40692 756 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 RGS2P41220 211 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 AVPR1BP47901 424 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CCT8P50990 548 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 COPB1P53618 953 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 UFM1P61960 85 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 FOXE3Q13461 319 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CUL4AQ13619 759 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 NAA25Q14CX7 972 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 GXYLT1Q4G148 440 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PCID2Q5JVF3 399 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 SH2D4BQ5SQS7 431 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ZNF280DQ6N043 979 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 RTL10Q7L3V2 364 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ZNF804AQ7Z570 1209 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CPLX4Q7Z7G2 160 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MON1AQ86VX9 555 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TMEM200AQ86VY9 491 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 BRSK2Q8IWQ3 736 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PALM2Q8IXS6 379 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 LSMEM1Q8N8F7 131 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TERB1Q8NA31 727 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 KCNJ9Q92806 393 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 SAAL1Q96ER3 474 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 HIC2Q96JB3 615 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 GPR78Q96P69 363 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 EYA3Q99504 573 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 HDHD5Q9BXW7 423 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ITPAQ9BY32 194 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CIPCQ9C0C6 399 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MROH8Q9H579 483 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 EPHX3Q9H6B9 360 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 BRF2Q9HAW0 419 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ANKEF1Q9NU02 776 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 ASIC5Q9NY37 505 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 MPP6Q9NZW5 540 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 HDAC6Q9UBN7 1215 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 VPS28Q9UK41 221 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 SARDHQ9UL12 918 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CAMK2AQ9UQM7 478 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 CLDN16Q9Y5I7 305 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 PASKQ96RG2 1323 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 TMEM247A6NEH6 219 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 C16orf96A6NNT2 1141 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1280P-201ENST00000365211 LINC00473A8K010 186 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms