RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHBDL3P58872 404 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPATQ06203 517 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMPCAQ10713 525 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXO1Q12778 655 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGR1Q14914 329 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR162Q16538 588 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG10Q5BKT4 473 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRAGAQ7L523 313 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 LPAR1Q92633 364 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGSQ96S52 555 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPAS1Q99742 590 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEH1Q9H213 219 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TASP1Q9H6P5 420 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL15Q9NXU5 204 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKP3Q9Y446 797 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNJ18B7U540 433 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEURL1O76050 574 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCKP06239 509 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHAGQ02094 409 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK18Q07002 472 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIGD6Q17RP2 521 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 GXYLT1Q4G148 440 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC174Q6PII3 467 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC25Q86WR0 208 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL21RQ9HBE5 538 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROB1E7EW31 1015 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0Y3Z8 333 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YGN5 161 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 MDM4O15151 490 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP21A2P08686 494 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGB6P18564 788 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPH2P23942 346 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHKAP35790 457 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLD2P49005 469 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTR6P50406 440 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 OAZ1P54368 228 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDCLQ13371 301 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT72Q14CN4 511 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS52Q8N1B4 723 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PELI3Q8N2H9 469 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUBCNQ92622 972 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA1Q92805 767 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNJ9Q92806 393 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARRDC3Q96B67 414 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLPBQ9H078 707 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF146Q9NTX7 359 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCND3Q9UK17 655 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCE1Q9Y256 329 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms