RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRAF2Q12933 501 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEMA5AQ13591 1074 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HNF4GQ14541 408 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRM3Q14832 879 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC39A14Q15043 492 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DUSP6Q16828 381 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC5A9Q2M3M2 681 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ODR4Q5SWX8 454 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MSANTD2Q6P1R3 559 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KIAA0408Q6ZU52 694 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CLIP4Q8N3C7 705 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RFLNBQ8N5W9 214 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAGEB6Q8N7X4 407 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EXD3Q8N9H8 876 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP11CQ8NB49 1132 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC150Q8NCX0 1101 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM216AQ8WUB2 273 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC22A17Q8WUG5 538 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAR2Q96K12 515 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DUX5Q96PT3 197 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 B3GNT4Q9C0J1 378 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF304Q9HCX3 659 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TXNRD2Q9NNW7 524 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNK9Q9NPC2 374 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FSCN3Q9NQT6 498 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 POM121BA6NF01 834 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SAC3D1A6NKF1 404 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VSTM5A8MXK1 200 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 J3KTA2 159 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AREL1O15033 823 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DHHO43323 396 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNJ13O60928 360 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGSF3O75054 1194 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SRGAP2BP0DMP2 458 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PEPDP12955 493 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGFBP2P18065 325 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EGR1P18146 543 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC16A2P36021 539 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 STAT1P42224 750 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ACSM2AQ08AH3 577 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRAF3Q13114 568 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KIF19Q2TAC6 998 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF284Q2VY69 593 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CEP85LQ5SZL2 805 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANKRD40Q6AI12 368 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NXNQ6DKJ4 435 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF449Q6P9G9 518 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF367Q7RTV3 350 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KLBQ86Z14 1044 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TCEAL8Q8IYN2 117 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC33Q8N5R6 958 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KDM1BQ8NB78 822 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PKP4Q99569 1192 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NUP62CLQ9H1M0 184 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KLHL31Q9H511 634 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SFXN1Q9H9B4 322 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SDF2L1Q9HCN8 221 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DONSONQ9NYP3 566 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGSF9Q9P2J2 1179 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A0A1W2PPC4 97 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RHPN2P1A8MT19 583 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MCIDASD6RGH6 385 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 STMND1H3BQB6 276 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 M0QYT0 321 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NKX2-8O15522 239 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ASAP2O43150 1006 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LDB2O43679 373 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NDST3O95803 873 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SERPINB2P05120 415 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 F7P08709 466 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TSHRP16473 764 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GABRB3P28472 473 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHRNA5P30532 468 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AVPR1AP37288 418 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP3CCP48454 512 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AMTP48728 403 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NUDT6P53370 316 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF543Q08ER8 600 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GALEQ14376 348 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CSHL1Q14406 222 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP2R5AQ15172 486 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AAK1Q2M2I8 961 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM71Q6P5X7 295 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DSTYKQ6XUX3 929 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BEND5Q7L4P6 421 aa1.99□□□□□ -2.09
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IGFN1Q86VF2 1251 aa1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms