RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAS8O95995 478 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCARP24071 287 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT2Q10471 571 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDH18Q13634 790 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 OASLQ15646 514 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC45A4Q5BKX6 768 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF354CQ86Y25 554 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC49Q8IUZ0 686 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRF7Q92985 503 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC3BQ96PB8 259 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A8Q9C0K1 460 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLC2Q9H0B6 622 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPHK2Q9NRA0 654 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP69A5D8W1 941 aa28.13■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOCP08134 193 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP1B1Q10567 949 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R7Q15435 360 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANO4Q32M45 955 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARP15Q460N3 678 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATPAF2Q8N5M1 289 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELSPBP1Q96BH3 223 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM121Q9BTD3 319 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF212Q9UDV6 495 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBTPS2O43462 519 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 GARSP41250 739 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM25Q86YD3 366 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFN1Q8IWA4 741 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC1Q9BTT6 524 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 BBS2Q9BXC9 721 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASA4BC9J798 803 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASA4O43374 803 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD51CO43502 376 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 STIP1P31948 543 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDGFRLQ15198 375 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 VITQ6UXI7 678 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TP53INP2Q8IXH6 220 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC89Q8N998 374 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDAC11Q96DB2 347 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEH1Q9H213 219 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa28.12■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM187AA6NFU0 413 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTI1O43156 1089 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFATC1O95644 943 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADH1CP00326 375 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOXF2BP0C7M4 288 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETFBP38117 255 aa28.11■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ALLCQ8N6M5 410 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLCO2A1Q92959 643 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP2A3Q93084 1043 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOXF2Q9BQY4 288 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf88Q9H8K7 445 aa28.11■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ECI2O75521 394 aa28.1■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FYB2Q5VWT5 728 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARM1Q6UWI2 310 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF783Q6ZMS7 281 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYRIPQ8NFW9 859 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMCESQ96FZ2 354 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MUC3BQ9H195 1237 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 V9GYY5 206 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNB1P01574 187 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMC3P17980 439 aa28.09■■■□□ 2.09
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