RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NEPROQ6NW34 567 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ALLCQ8N6M5 410 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RORBQ92753 470 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SEC22BO75396 215 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 YWHAQP27348 245 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PALB2Q86YC2 1186 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PRELID2Q8N945 189 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM159Q96B96 161 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 KATNA1O75449 491 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 FAM228AQ86W67 206 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DEPDC5O75140 1603 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCQQ04759 706 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DUPD1Q68J44 220 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MIEF2Q96C03 454 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PANX3Q96QZ0 392 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 USP20Q9Y2K6 914 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0B4J269 797 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 POMCP01189 267 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SHBGP04278 402 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NEK3P51956 506 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2R1Q6VVX0 501 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STARD8Q92502 1023 aa21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TISP43B9A030 160 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TPP1O14773 563 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ITGAVP06756 1048 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA6P08133 673 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PDK4Q16654 411 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PCID2Q5JVF3 399 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 AADACL2Q6P093 401 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MPP4Q96JB8 637 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 EPHB6O15197 1021 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 WBP4O75554 376 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 FGD2Q7Z6J4 655 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OR8H2Q8N162 312 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM32Q8TC27 787 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN10Q9HC96 672 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 MED26O95402 600 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STARD3Q14849 445 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 DACT2Q5SW24 774 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ARCQ7LC44 396 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 HSFY1Q96LI6 401 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CEP44Q9C0F1 390 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 BTN3A1O00481 513 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RGS14O43566 566 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 STK40Q8N2I9 435 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RERGLQ9H628 205 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.5■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OR56A5P0C7T3 313 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PHACTR4Q8IZ21 702 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf18Q8NEA5 215 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ITFG1Q8TB96 612 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LENG9Q96B70 501 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 OPTNQ96CV9 577 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 CIPCQ9C0C6 399 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF614Q8N883 585 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.49■■□□□ 1.03
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms