RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SIX2Q9NPC8 291 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 THAP1Q9NVV9 213 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GID8Q9NWU2 228 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 NRCAMQ92823 1304 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 BTBD19C9JJ37 291 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 C9JVG2 144 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 ZNF682O95780 498 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 FGFR1P11362 822 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 PGS1Q32NB8 556 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 MICU2Q8IYU8 434 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 METTL6Q8TCB7 284 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ZNF516Q92618 1163 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CERS2Q96G23 380 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SEMA3CQ99985 751 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SOX13Q9UN79 622 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 AK5Q9Y6K8 562 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 NCANO14594 1321 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 M0R2N6 131 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PPIL2Q13356 520 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SEMA5AQ13591 1074 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 BNIPLQ7Z465 357 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 ZNF410Q86VK4 478 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TMPRSS6Q8IU80 811 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FNDC5Q8NAU1 212 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SEPT8Q92599 483 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MYLPFQ96A32 169 aa5.62□□□□□ -1.51
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LMO3-201ENST00000261169 MFSD3Q96ES6 412 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MAGED4Q96JG8 741 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 HBEGFQ99075 208 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FAM105AQ9NUU6 356 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 PNPOQ9NVS9 261 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MYH2Q9UKX2 1941 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 MYPNQ86TC9 1320 aa5.62□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.61□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa5.61□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 C5orf58C9J3I9 102 aa5.61□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 FFAR3O14843 346 aa5.61□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 GPR42O15529 346 aa5.61□□□□□ -1.51
LMO3-201ENST00000261169 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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