RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258449.2

TGFBRAP1-201, Transcript of transforming growth factor beta receptor associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TGFBRAP1, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBRAP1-201ENST00000258449 POU5F1BQ06416 359 aa14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 LAMC2Q13753 1193 aa14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GSTA3Q16772 222 aa14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PDSS2Q86YH6 399 aa14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.5□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 KPNA7A9QM74 516 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 HACD1B0YJ81 288 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 EPHA3P29320 983 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NUDT2P50583 147 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 KLF10Q13118 480 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PDK1Q15118 436 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 OSTM1Q86WC4 334 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 RBBP8Q99708 897 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PDP2Q9P2J9 529 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ZNF487B1APH4 448 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CFLARO15519 480 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 DEUP1Q05D60 604 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ITGA7Q13683 1181 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 KYAT1Q16773 422 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 TMEM198Q66K66 360 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 STRADAQ7RTN6 431 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GCNAQ96QF7 691 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CPNE1Q99829 537 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CDH19Q9H159 772 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.49□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 G3V2L1 256 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 I6L893 689 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 C2P06681 752 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ERCC2P18074 760 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PTPN3P26045 913 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 UNC93AQ86WB7 457 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NPWQ8N729 165 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 USP33Q8TEY7 942 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 A0A1B0GVG6 124 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CAPN8A6NHC0 703 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NRP1O14786 923 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SERPINB8P50452 374 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PKNOX1P55347 436 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ZNF460Q14592 562 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ZBTB6Q15916 424 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 CYS1Q717R9 158 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SNX32Q86XE0 403 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ERO1BQ86YB8 467 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 APPL2Q8NEU8 664 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 MED10Q9BTT4 135 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NUF2Q9BZD4 464 aa14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GSTT1P30711 240 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GRIA2P42262 883 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 LIMK2P53671 638 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 MAP3K7CLP57077 242 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 MED21Q13503 144 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 MMEL1Q495T6 779 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 GRTP1Q5TC63 336 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 NXNQ6DKJ4 435 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 AAGABQ6PD74 315 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.47□□□□□ -0.09
TGFBRAP1-201ENST00000258449 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms