RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252456.6

CNN1-201, Transcript of calponin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN1, Length 1,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1-201ENST00000252456 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SRGAP2O75044 1071 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 C7P10643 843 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ZNF75DP51815 510 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 COPAP53621 1224 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SLC12A1Q13621 1099 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 LPAL2Q16609 132 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 KBTBD6Q86V97 674 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 FRMD1Q8N878 549 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CD93Q9NPY3 652 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 INVSQ9Y283 1065 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SCINQ9Y6U3 715 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 THADAQ6YHU6 1953 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 LRIG2O94898 1065 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ASLP04424 464 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CYP1A2P05177 515 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 EPHX1P07099 455 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 BCKDHBP21953 392 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PSMA2P25787 234 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 P2RY2P41231 377 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SEMA3BQ13214 749 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 E2F5Q15329 346 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SLC18A3Q16572 532 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 LRRC31Q6UY01 552 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 TC2NQ8N9U0 490 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 RLN3Q8WXF3 142 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PEBP4Q96S96 227 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MTG2Q9H4K7 406 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 FZD10Q9ULW2 581 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 LRCH4O75427 683 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 GALCP54803 685 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ECT2LQ008S8 904 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 STARD3Q14849 445 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 NLRP14Q86W24 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CNGA4Q8IV77 575 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 KDM1BQ8NB78 822 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PSMB7Q99436 277 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 NUP205Q92621 2012 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 A0A0D9SEW6 157 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MOCS3O95396 460 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 TPM1P09493 284 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 AIF1P55008 147 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 OXCT1P55809 520 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PLK5Q496M5 336 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CEP68Q76N32 757 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 DCLK2Q8N568 766 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.62□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 TTC34A8MYJ7 566 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 RHOCP08134 193 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 TCF4P15884 667 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 MIPP30301 263 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 OR1E1P30953 314 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 L1CAMP32004 1257 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 CA9Q16790 459 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 EFHC2Q5JST6 749 aa14.61□□□□□ -0.07
CNN1-201ENST00000252456 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms