RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rhobtb2Q91V93 728 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Yaf2Q99LW6 179 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hes6Q9JHE6 224 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smad9Q9JIW5 430 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smpd3Q9JJY3 655 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa9.49□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ncam2O35136 837 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfm1O88998 485 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TubP50586 505 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stt3bQ3TDQ1 823 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 C1orf109Q499E6 217 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sema4bQ62179 823 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Iqsec1Q8R0S2 961 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pin4Q9CWW6 131 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Egfl7Q9QXT5 275 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smok3cA0A087WSF2 504 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm12794L7MTS5 483 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hps1O08983 704 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lire1P11260 357 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 FynP39688 537 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Frg1P97376 258 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Smad5P97454 465 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Abi3bpQ59IW6 1179 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr301Q7TS04 311 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Grik4Q8BMF5 956 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Acvr1cQ8K348 493 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lars2Q8VDC0 902 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam227aQ9D3V8 625 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lrrc71Q9D3W5 558 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 S100zB9EJL3 99 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AprtP08030 180 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pnpla5Q32LZ8 432 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lpcat1Q3TFD2 534 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Brip1Q5SXJ3 1174 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dlg4Q62108 724 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chst10Q6PGK7 356 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klhl17Q6TDP3 640 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Camk1dQ8BW96 385 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Btbd9Q8C726 612 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ndufs2Q91WD5 463 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Akr1c21Q91WR5 323 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CatsperzQ9CQP8 194 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sesn3Q9CYP7 492 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kifc1Q9QWT9 674 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Angpt1O08538 498 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 MipP51180 263 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Morf4l1P60762 362 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 NfycP70353 335 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pla2g6P97819 807 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Itga7Q61738 1179 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Podnl1Q6P3Y9 559 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PolnQ7TQ07 864 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr389Q7TRX7 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 IntS13Q8QZV7 732 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr589Q8VGV8 317 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dctn2Q99KJ8 402 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ndufb5Q9CQH3 189 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cep97Q9CZ62 856 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2c55Q9D816 490 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pou5f2Q9DAC9 329 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hmg20aQ9DC33 346 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fbxo16Q9QZM9 334 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam166bA2AIP0 273 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 TpteG5E8H5 664 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc16a8O35308 492 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pknox1O70477 436 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Stk16O88697 305 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PdgfaP20033 211 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gria1P23818 907 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Defa17Q64016 82 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Setdb2Q8C267 713 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Spdye4bQ8CDE8 236 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmprss4Q8VCA5 435 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr330Q8VGD9 315 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Itfg1Q99KW9 610 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 AcadsbQ9DBL1 432 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Mrps15Q9DC71 258 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Htra2Q9JIY5 458 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 H2afb2S4R1M3 115 aa9.48□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zbed6D2EAC2 980 aa9.47□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm2956E9PVJ0 216 aa9.47□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm10477F6SW83 55 aa9.47□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm8108K7N734 216 aa9.47□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3739L7N296 216 aa9.47□□□□□ -0.89
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3164L7N2B9 238 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms