RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CPS1P31327 1500 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLKQ9UBT6 870 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EID1Q9Y6B2 187 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FCHSD2O94868 740 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE4AP27815 886 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL16Q14005 1332 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LTKP29376 864 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AAMPQ13685 434 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEFMP07197 916 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BACH2Q9BYV9 841 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIPK4P57078 832 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NME9Q86XW9 330 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PANK1Q8TE04 598 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLIT1O75093 1534 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COG6Q9Y2V7 657 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C3P01024 1663 aa23.98■■□□□ 1.43
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBLN1P23142 703 aa23.96■■□□□ 1.43
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBX22Q9Y458 520 aa23.96■■□□□ 1.43
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITSN1Q15811 1721 aa23.95■■□□□ 1.42
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.94■■□□□ 1.42
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SKAP1Q86WV1 359 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPRUQ92729 1446 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NFE2L2Q16236 605 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ACEP12821 1306 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTCH1Q13635 1447 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHDP01880 384 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DIP2AQ14689 1571 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HMOX1P09601 288 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RLBP1P12271 317 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM161AQ3B820 660 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP6P35125 1406 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF428Q96B54 188 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNNQ9UQP3 1299 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGS3P49796 1198 aa23.83■■□□□ 1.41
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