RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 USP19O94966 1318 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMM44-210ENST00000599939 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMM44-210ENST00000599939 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
TIMM44-210ENST00000599939 CDK19Q9BWU1 502 aa25.78■■□□□ 1.72
TIMM44-210ENST00000599939 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.77■■□□□ 1.72
TIMM44-210ENST00000599939 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.76■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 SEC24BO95487 1268 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 CABP1Q9NZU7 370 aa25.74■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 REREQ9P2R6 1566 aa25.74■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 NFKBIBQ15653 356 aa25.73■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 ZMYM3Q14202 1370 aa25.73■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.73■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 DLC1Q96QB1 1528 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 DIP2BQ9P265 1576 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 IL16Q14005 1332 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 TSPOAP1O95153 1857 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 AGLP35573 1532 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM44-210ENST00000599939 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.7■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.7■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.7■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 TRIM27P14373 513 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 RIPK4P57078 832 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.68■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 ATP7BP35670 1465 aa25.68■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.66■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.66■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.65■■□□□ 1.7
TIMM44-210ENST00000599939 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.64■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.63■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 FCHSD2O94868 740 aa25.63■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 FBLN1P23142 703 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 POLKQ9UBT6 870 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.62■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.61■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.61■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.6■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 PRKAR2BP31323 418 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
TIMM44-210ENST00000599939 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 KIF16BQ96L93 1317 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 GSE1Q14687 1217 aa25.55■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.54■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.54■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 BECN1Q14457 450 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 METP08581 1390 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 MLECQ14165 292 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.53■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.52■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
TIMM44-210ENST00000599939 HMOX1P09601 288 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 SMC5Q8IY18 1101 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 NFE2L2Q16236 605 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 NME9Q86XW9 330 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.5■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 IL13P35225 146 aa25.48■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.48■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 ZNF428Q96B54 188 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 CPS1P31327 1500 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 AKAP12Q02952 1782 aa25.46■■□□□ 1.67
TIMM44-210ENST00000599939 TECPR2O15040 1411 aa25.45■■□□□ 1.66
TIMM44-210ENST00000599939 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
TIMM44-210ENST00000599939 C3P01024 1663 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM44-210ENST00000599939 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TIMM44-210ENST00000599939 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM44-210ENST00000599939 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM44-210ENST00000599939 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms