RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 NSD2O96028 1365 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC27Q2M243 656 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 PRKAR2BP31323 418 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 NFKBIBQ15653 356 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 TRIM27P14373 513 aa21.39■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 TSPOAP1O95153 1857 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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CTDP1-207ENST00000591598 NME9Q86XW9 330 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 SOX12O15370 315 aa21.36■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 RICTORQ6R327 1708 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 POLKQ9UBT6 870 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.33■■□□□ 1.01
CTDP1-207ENST00000591598 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.33■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 ZFYVE9O95405 1425 aa21.31■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 USP35Q9P2H5 1018 aa21.31■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.31■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.31■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.3■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 USP19O94966 1318 aa21.3■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 ALKQ9UM73 1620 aa21.29■■□□□ 1
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CTDP1-207ENST00000591598 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.28■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 USP32Q8NFA0 1604 aa21.28■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.27■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.27■■□□□ 1
CTDP1-207ENST00000591598 FCHSD2O94868 740 aa21.27■■□□□ 1
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CTDP1-207ENST00000591598 DCTN1Q14203 1278 aa21.27■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.26■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 FAM83GA6ND36 823 aa21.25■□□□□ 0.99
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CTDP1-207ENST00000591598 TSPYL6Q8N831 410 aa21.25■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 LNPKQ9C0E8 428 aa21.25■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 METP08581 1390 aa21.24■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 COG3Q96JB2 828 aa21.24■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 BECN1Q14457 450 aa21.23■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.23■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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CTDP1-207ENST00000591598 IL27Q8NEV9 243 aa21.22■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 AAMPQ13685 434 aa21.22■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.22■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 NFE2L2Q16236 605 aa21.21■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.21■□□□□ 0.99
CTDP1-207ENST00000591598 KIF16BQ96L93 1317 aa21.2■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 GSE1Q14687 1217 aa21.2■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 ADGRB2O60241 1585 aa21.18■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 ARXQ96QS3 562 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 IL16Q14005 1332 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 MBIPQ9NS73 344 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 IL13P35225 146 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.16■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 ZMYM3Q14202 1370 aa21.15■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 VAMP4O75379 141 aa21.14■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.14■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.14■□□□□ 0.98
CTDP1-207ENST00000591598 KRT24Q2M2I5 525 aa21.14■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.14■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.13■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 GNAI1P63096 354 aa21.13■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.12■□□□□ 0.97
CTDP1-207ENST00000591598 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.11■□□□□ 0.97
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