RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.49■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.49■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.49■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 COG3Q96JB2 828 aa29.49■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.48■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 ACEP12821 1306 aa29.48■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.313e-8■□□□□ 9.8
USP36-218ENST00000590546 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 NME9Q86XW9 330 aa29.46■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 SLFN5Q08AF3 891 aa29.45■■■□□ 2.31
USP36-218ENST00000590546 USP6P35125 1406 aa29.44■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 E9PSI1 815 aa29.44■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.44■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 POLKQ9UBT6 870 aa29.44■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.43■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.43■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 CCDC27Q2M243 656 aa29.43■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.42■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.41■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.4■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 NUTM2FA1L443 756 aa29.39■■■□□ 2.3
USP36-218ENST00000590546 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 WWC1Q8IX03 1113 aa29.39■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 SSH2Q76I76 1423 aa29.37■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.37■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 WDR63Q8IWG1 891 aa29.36■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.33■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.33■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 FCHSD2O94868 740 aa29.33■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.33■■■□□ 2.29
USP36-218ENST00000590546 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.32■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.32■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.31■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.3■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 USP31Q70CQ4 1352 aa29.29■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.29■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.29■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 NWD1Q149M9 1564 aa29.28■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 NEUROD2Q15784 382 aa29.28■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 NEFMP07197 916 aa29.27■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
USP36-218ENST00000590546 FBLN1P23142 703 aa29.26■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 IL13P35225 146 aa29.24■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.21■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.21■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.21■■■□□ 2.27
USP36-218ENST00000590546 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.2■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.18■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 IL16Q14005 1332 aa29.18■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.16■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 C14orf37Q86TY3 774 aa29.16■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 PRKAR2BP31323 418 aa29.16■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.16■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 USP54Q70EL1 1684 aa29.14■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 RIPK4P57078 832 aa29.14■■■□□ 2.26
USP36-218ENST00000590546 PIK3C2AO00443 1686 aa29.13■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.13■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.11■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 NLRP6P59044 892 aa29.11■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.11■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 SBNO1A3KN83 1393 aa29.1■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 PLIN1O60240 522 aa29.09■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 NFE2L2Q16236 605 aa29.09■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.09■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 FLT4P35916 1363 aa29.09■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 HMOX1P09601 288 aa29.08■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.08■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
USP36-218ENST00000590546 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.07■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 ABTB2Q8N961 1025 aa29.07■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.07■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.06■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 PEAK1Q9H792 1746 aa29.05■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 PSME1Q06323 249 aa29.04■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 AMPHP49418 695 aa29.02■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.02■■■□□ 2.24
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