RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585149.1

TSPOAP1-211, Transcript of TSPO associated protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1, Length 381 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-211ENST00000585149 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABTB2Q8N961 1025 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 ARHGEF10O15013 1369 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 JCADQ9P266 1359 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.46■■□□□ 1.35
TSPOAP1-211ENST00000585149 NLRP13Q86W25 1043 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 SSH2Q76I76 1423 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 NLRP6P59044 892 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 ALS2Q96Q42 1657 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 SHPRHQ149N8 1683 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPOAP1-211ENST00000585149 PLEKHG5O94827 1062 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 NME9Q86XW9 330 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 COG3Q96JB2 828 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 FYB1O15117 783 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 PIK3C2AO00443 1686 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 NSD2O96028 1365 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 USP31Q70CQ4 1352 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-211ENST00000585149 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 USP19O94966 1318 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 GCP02774 474 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 MORC1Q86VD1 984 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 SOX12O15370 315 aa23.27■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 ADAMTS2O95450 1211 aa23.27■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 USP54Q70EL1 1684 aa23.27■■□□□ 1.32
TSPOAP1-211ENST00000585149 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.27■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.26■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.26■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLIT3O75094 1523 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCA3Q99758 1704 aa23.23■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.23■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.23■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.22■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TSPOAP1-211ENST00000585149 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 NGLY1Q96IV0 654 aa23.2■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 CPDO75976 1380 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 C8orf37Q96NL8 207 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIAA0232Q92628 1395 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.17■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 LRP6O75581 1613 aa23.17■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 AMPHP49418 695 aa23.16■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 NFAT5O94916 1531 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 FAM83GA6ND36 823 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 RALBP1Q15311 655 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPOAP1-211ENST00000585149 CHRNA2Q15822 529 aa23.14■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 LTN1O94822 1766 aa23.13■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 FBLN1P23142 703 aa23.12■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 EVA1CP58658 441 aa23.12■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.11■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 ANP32CO43423 234 aa23.11■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 BTG4Q9NY30 223 aa23.11■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.11■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 IP6K1Q92551 441 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 POLKQ9UBT6 870 aa23.09■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 USP21Q9UK80 565 aa23.09■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 RTL1A6NKG5 1358 aa23.09■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 AFF2P51816 1311 aa23.08■■□□□ 1.29
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCC6O95255 1503 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms